支付双倍工资差额的法律性质在《劳动合同法》上并没有明确界定。如认定为劳动报酬，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定：“劳动报酬的仲裁时效为劳动关系终止之日起一年；如认定为民事惩罚，则仲裁时效为一年，从知道或应当指知道权利被侵害之日起计算。”
根据《劳动部办公厅关于印发《关于<劳动法>若干条文的说明》的通知》第三条：“劳动报酬”是指劳动者从用人单位得到的全部工资收入。我们倾向于认为，双倍工资差额不属于劳动报酬，应认定为民事惩罚。故其仲裁时效应从从知道或应当指知道权利被侵害之日起计算。
双倍工资差额从实际用工起第二月计算，最长不超过十一个月。但这十一个月的双倍工资差额的仲裁时效是整体计算还是分段计算，这在实践中也有争议。我们倾向于认为，用人单位不签订书面劳动合同，侵犯劳动者合法权益。而根据《劳动合同法》规定，自用工之日起一年不签订书面劳动合同，则视为无固定期限劳动合同，故该侵权行为的结束节点为用工之日起一年。鉴于该侵权行为具有持续性特点，应从侵权行为结束起开始计算一年仲裁时效。因此，整体计算仲裁时效更为恰当，也有利于保护劳动者权益。
